A E-Hive conta com uma metodologia própria de ensino em que cada aula é planejada para que o aluno se aproprie dos conhecimentos e se qualifique com aprendizagens significativas, ou seja, que lhes façam sentido e possam ser colocadas em prática não apenas no momento da aula, mas também posteriormente. Em sua estrutura, os cursos à distância são distribuídos em escolas com temáticas específicas como tecnologia, negócios, empreendedorismo e ESG.